Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms