Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms