Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms