Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms