Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms