Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms