Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms