Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms