Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms