Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CALML4Q96GE6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms