Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms