Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEURL3Q96EH8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEURL3Q96EH8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEURL3Q96EH8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEURL3Q96EH8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEURL3Q96EH8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms