Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR1Q969H4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNKSR1Q969H4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms