Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms