Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms