Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms