Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms