Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms