Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARRDC4Q8NCT1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC4Q8NCT1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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