Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP38Q8NB14 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms