Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms