Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms