Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG9AQ7Z3C6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms