Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms