Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSH2Q76I76 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms