Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM47EQ6ZV65 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms