Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN4Q6ZMN7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms