Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms