Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL54Q6P161 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms