Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms