Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms