Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A13Q5J8X5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A13Q5J8X5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms