Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms