Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRDTQ58F21 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRDTQ58F21 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms