Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZC2HC1CQ53FD0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC2HC1CQ53FD0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms