Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms