Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A52Q3SY17 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A52Q3SY17 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms