Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSM12Q3MHD2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms