Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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KRTAP21-3Q3LHN1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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