Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMPG1Q17R60 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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