Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNRD1Q16881 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms