Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms