Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
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