Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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