Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CCDC6Q16204 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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