Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms