Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF11Q15544 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF11Q15544 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF11Q15544 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF11Q15544 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF11Q15544 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF11Q15544 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF11Q15544 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms