Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUM3Q15397 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms