Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms