Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KARSQ15046 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KARSQ15046 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KARSQ15046 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KARSQ15046 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KARSQ15046 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KARSQ15046 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KARSQ15046 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KARSQ15046 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KARSQ15046 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KARSQ15046 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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